단일세포 공간 전사체학 데이터셋의 배치 효과 제거를 위한 통계적 정규화 방법론 비교 분석

단일세포 공간 전사체학 데이터는 실험 간 혹은 기술 플랫폼 간의 시스템적 편향인 배치 효과에 매우 취약하며, 이는 정확한 생물학적 해석을 저해한다.

정규화 접근법의 평가

• Harmony: 주로 클러스터링 수준에서 배치 정보를 반영하여 차원 축소를 수행하며, 빠르고 효과적이지만, 미묘한 생물학적 차이를 평준화할 위험이 있다.
• CCA (Canonical Correlation Analysis): 두 데이터셋 간의 상관관계 최대화를 목표로 하며, 강력하지만 계산 비용이 높고, 생물학적 의미가 있는 낮은 차원의 변화를 놓칠 수 있다.

이러한 방법론들은 각기 다른 가정 하에 작동하며, 최적의 정규화 전략은 연구 질문과 데이터의 특성(예: mRNA 꼬리 구조 변화의 정도)에 따라 달라진다. 따라서 여러 방법을 조합하거나, 해당 현상을 직접적으로 모델링하는 시스템 생물학적 접근이 필요하다.